По объему работы патологоанатомическое отделение входит в первую десятку патологоанатомических отделений, которые выполняют более 50% всего объема работы в городе Москве. В настоящее время первый этаж занимает ритуальный зал, секционная на три стола и трупохранилище на 30 мест в холодильных установках фирмы Leek. Лаборатория занимает второй этаж. Патологоанатомическое отделение полностью оснащено современными микроскопами, включая иммунофлуоресцентный, современным гистологическим оборудованием (роторные микротомы с использованием одноразовых ножей; микротом криостат для осуществления срочных интраоперационных гистологических и иммуноморфологических исследований; термостаты; автоматы для гистологической обработки тканей; заливочный центр и т.д.).

Особенность работы патологоанатомического отделения, связана с тем, что в штате больницы имеются такие специализированные отделения как:

• гематологическое отделение с исследованиями трепанобиопсий, лимфатических узлов, слизистых оболочек желудочно-кишечного тракта при заболеваниях и новообразованиях крови.
• урологическое отделение с исследованием почек, секторальных биопсий предстательной железы.
• ревматологическое отделение с исследованием кожи и мягких тканей для выявления заболеваний соединительной ткани.
• сурдологическое отделение с исследованием слизистых носа и органов слуха при новообразованиях, васкулитах и воспалительных процессах разной этиологии.
• терапевтическое отделение с заболеваниями органов дыхания с биопсиями слизистых верхних дыхательных путей.
• нефрологические отделения с исследованием удаленных почек с разнообразной патологией, включая аллотрансплантат почки, исследование почечных биопсий для верификации почечной патологии и отторжения трансплантированной почки, биопсии печени при вирусных гепатитах.
• отделение аллергологии с исследованием биопсий верхних дыхательных путей, кожи, лимфатических узлов.

Патологоанатомическое отделение осуществляет:

• прижизненную диагностику путем гистологического исследования операционного и биопсийного материала, как с использованием обзорных окрасок гематоксилином и эозином, так и гистохимических методик с определением соединительной ткани, слизи, липидов, гликозаминогликанов, фибрина и фибриноида.
• с использованием моноспецифических сывороток для последующей иммунофлуоресцентной микроскопии.
• с использованием гематологической окраски по Романовскому-Гимза.
• с выявлением бактерий в тканях по Грамму, микобактерий по Циль-Нильсону, хеликобактерий по Романовскому-Гимза, патогенных грибов Шик-реакцией и др.